清空記錄
歷史記錄
取消
清空記錄
歷史記錄
1 引言
赤潮作為一種全球性的海洋災(zāi)害,嚴(yán)重阻礙了海洋生態(tài)和經(jīng)濟(jì)的發(fā)展。隨著全球,特別是我國(guó)近海赤潮頻發(fā),確定赤潮類型和濃度從而科學(xué)有效地防治和減小赤潮危害,已成為海洋環(huán)境保護(hù)的重要課題。
目前,赤潮檢測(cè)的方法主要有:觀察法、遙感檢測(cè)和光譜檢測(cè)。傳統(tǒng)的人工觀察操作過程復(fù)雜,對(duì)操作人員專業(yè)性要求高。遙感檢測(cè)受海面魚鱗光、天氣等自然環(huán)境的影響檢測(cè)精度低。光譜技術(shù)主要包括吸收光譜、熒光光譜和高光譜成像(HSI)技術(shù)。吸收光譜技術(shù)測(cè)量范圍廣,但靈敏度低,抗干擾能力差。熒光光譜技術(shù)靈敏度高,但檢測(cè)設(shè)備價(jià)格昂貴。HSI是一種對(duì)圖像和光譜進(jìn)行融合的技術(shù),具有較高的檢測(cè)精度,為微藻種類鑒別和細(xì)胞濃度檢測(cè)提供了一種快速、準(zhǔn)確的測(cè)量方法。
赤潮藻細(xì)胞內(nèi)含有多種色素,不同色素種類和比例都會(huì)引起赤潮藻吸收光譜和熒光光譜的變化?;诖死弥С窒蛄繖C(jī)成功鑒別了海洋卡盾藻、東海原甲藻和球形棕囊藻。但由于某些赤潮藻種所含色素種類相近而難以區(qū)分,如甲藻、硅藻和針胞藻,利用光譜技術(shù)對(duì)其進(jìn)行鑒別的研究鮮有報(bào)道。光譜也廣泛運(yùn)用于濃度測(cè)量中,但受到濃度大小和范圍的限制,在低濃度赤潮藻檢測(cè)中運(yùn)用較少,而多用于高濃度經(jīng)濟(jì)微藻的檢測(cè)。
針對(duì)甲藻、硅藻和針胞藻的光譜檢測(cè)困難,且低細(xì)胞濃度藻液的光譜預(yù)測(cè)模型精度較低的問題,搭建HSI系統(tǒng),采集了大量甲藻(強(qiáng)壯前溝藻)、硅藻(中肋骨條藻和三角褐指藻)和針胞藻(赤潮異灣藻)的光譜數(shù)據(jù),對(duì)比了不同光譜預(yù)處理手段、波段篩選算法與建模方法的交互影響及其對(duì)藻種鑒別和藻細(xì)胞濃度測(cè)量的影響。
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 藻種和培養(yǎng)條件
選擇福建省周邊海域常見的4種赤潮藻為檢測(cè)樣本,分別為強(qiáng)壯前溝藻、赤潮異灣藻、中肋骨條藻和三角褐指藻,使用F/2培養(yǎng)基培養(yǎng),鹽度為30~35g·L-1,pH為8.0,溫度控制在22℃,光照強(qiáng)度為6300lux,光照周期為14L:10D。
2.2 藻種和培養(yǎng)條件
2.2.1樣本制備和生物量測(cè)量
取指數(shù)增長(zhǎng)期的藻種(104~106cells·mL-1)加入人工海水進(jìn)行稀釋,每個(gè)藻種設(shè)置不少于10個(gè)濃度梯度(稀釋1、2、3、4、5、6、7、8、9、10倍),稀釋到接近赤潮發(fā)生時(shí)的基準(zhǔn)濃度。藻細(xì)胞濃度用血球計(jì)數(shù)板和浮游植物計(jì)數(shù)框在顯微鏡下獲得。每個(gè)濃度設(shè)置不少于5個(gè)平行樣本,每個(gè)樣本采集兩次取平均,4個(gè)藻種樣本總數(shù)為398。
2.2.2光譜采集系統(tǒng)搭建
搭建的高光譜采集系統(tǒng)如圖1所示,包括高光譜相機(jī)、鹵素光源、背景板、培養(yǎng)皿、暗箱和電腦。將藻液樣品充分?jǐn)嚢杈鶆?,用移液槍取?mL放入直徑為35mm培養(yǎng)皿中,通過高光譜數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)采樣。
圖1 高光譜成像系統(tǒng)示意圖
2.2.3高光譜數(shù)據(jù)校正和提取
為了減少系統(tǒng)誤差和外部環(huán)境的不利影響,采用式(1)獲得校正后的高光譜圖像反射率
式(1)中,Rci為校正后的光譜,Sampleci為原始高光譜圖像,Whiteci和Darkci分別為反射率99%標(biāo)準(zhǔn)白板圖像和蓋上鏡頭蓋獲得的暗電流圖像。
原始高光譜圖像通過式(1)校正后,用ENVI5.1選取藻液所在區(qū)域作為感興趣區(qū)域(平均大小為以70pixel為直徑的圓),計(jì)算感興趣區(qū)域光譜反射率的平均值作為樣本的光譜反射率。對(duì)獲取的所有樣本的光譜反射率數(shù)據(jù),采用SPXY算法(SPXY)按照2:1的比例劃分建模集和預(yù)測(cè)集?;瘜W(xué)計(jì)量學(xué)算法和數(shù)字圖像處理技術(shù)主要由Matlab2018a、Unscramblerversion10.4、OriginPro2021軟件實(shí)現(xiàn)。
2.3 預(yù)測(cè)模型建立
光譜預(yù)測(cè)模型建立包括光譜數(shù)據(jù)預(yù)處理、特征波段提取和模型建立三個(gè)步驟。
2.3.1光譜數(shù)據(jù)預(yù)處理
高光譜圖像采集過程受光源電壓不穩(wěn)定、光線不均勻、儀器精度等因素的影響。采集的光譜往往帶有不同程度的噪聲,在提取特征波段進(jìn)行建模時(shí),這種噪聲的影響可能會(huì)導(dǎo)致建模效果差、魯棒性低。光譜預(yù)處理可以減少噪聲對(duì)特征波段提取以及建模的影響,從而提高預(yù)測(cè)模型的精度。表1所示為篩選的7種預(yù)處理方法及其特點(diǎn)。
表1 所選光譜預(yù)處理方法及其特點(diǎn)
2.3.2特征波段選擇
高光譜數(shù)據(jù)量龐大,有效地去除背景信息,提取代表微藻信息的特征波段,有利于提高效率和準(zhǔn)確率。采用2種特征波段提取方法,分別是遺傳算法(GA)和連續(xù)投影算法(SPA)。
2.3.3建模
由于不同波段和類型的光譜特征有所不同,且檢測(cè)對(duì)象的目標(biāo)特性也不盡相同,因此,兩者間的關(guān)系具有不確定性。光譜建模算法各有優(yōu)勢(shì),需要針對(duì)不同的應(yīng)用對(duì)象,選擇合適的算法。本研究采用兩種分類方法和三種回歸模型分別進(jìn)行藻種鑒別和濃度測(cè)量,不同建模方法的特點(diǎn)如表2所示。
表2 所選光譜建模方法及其特點(diǎn)
2.3.4模型評(píng)估
藻種鑒別模型利用準(zhǔn)確率進(jìn)行評(píng)價(jià),而濃度測(cè)量模型則通過決定系數(shù)(R2)、平均絕對(duì)誤差(MAE)和平均相對(duì)誤差(MARE)來評(píng)價(jià),R2、MAE和MARE的值可由式(2)、式(3)和式(4)計(jì)算得到
i為第i個(gè)樣品的真值,ypre,i為第i個(gè)樣品的模型預(yù)測(cè)值,ymean所有樣品真值的平均值,n為樣品個(gè)數(shù)。
式中,n為樣本個(gè)數(shù),yi為第i個(gè)樣本真值,Yyi為第i個(gè)樣本預(yù)測(cè)值,MAE和MARE都大于0,其值越小,表示模型預(yù)測(cè)結(jié)果越好。
3 結(jié)果與討論
3.1 高光譜圖像的采集和黑白校正
赤潮發(fā)生時(shí)赤潮藻會(huì)消耗水中的溶解氧,導(dǎo)致動(dòng)物窒息性死亡,造成經(jīng)濟(jì)損失,影響海洋漁業(yè)的發(fā)展。如表3所示,強(qiáng)壯前溝藻(甲藻)、赤潮異灣藻(針胞藻)、中肋骨條藻(硅藻)和三角褐指藻(硅藻)對(duì)生態(tài)環(huán)境的影響各不相同。所以,通過光譜分析來實(shí)現(xiàn)藻種鑒別具有重要意義。
表3 四種赤潮藻的生物和光譜信息
圖2(a)-(d)分別顯示強(qiáng)壯前溝藻(細(xì)胞濃度在1.05×103~1.05×104cells·mL-1之間)、赤潮異灣藻(細(xì)胞濃度在1.05×104~ 2.51×105cells·mL-1之間)、中肋骨條藻(細(xì)胞濃度在1.13×104~ 2.38×105cells·mL-1之間)和三角褐指藻(細(xì)胞濃度在1.06×105~4.36×106cells·mL-1之間)的原始光譜曲線。如圖2(a)-(c)所示,強(qiáng)壯前溝藻和中肋骨條藻的光譜曲線形狀相似,在400~450和685~710nm分別存在一個(gè)較大的反射谷和反射峰??赡艿脑蚴菑?qiáng)壯前溝藻和中肋骨條藻色素種類和比例相似(見表3),受到葉綠素a(Chla)和葉綠素c(Chlc)的疊加作用在400~450nm形成一個(gè)較大的反射谷,而685~710nm的反射峰是赤潮水體的特征反射峰。如圖2(b)和(d)所示,赤潮異灣藻和三角褐指藻的光譜曲線形狀相似??赡艿脑蚴浅喑碑悶吃迮c三角褐指藻色含有大量Chla使得光譜曲線在440和675nm波段附近形成反射谷外,且都含有大量巖藻黃素使得光譜曲線在489~491nm處有反射谷(見表3)。所以,采用原始光譜很難將這四個(gè)種類的赤潮藻區(qū)分開,需要建立模型來表示藻種光譜信息與藻種類別之間的關(guān)系,以達(dá)到鑒別藻種的目的。
圖2 原始光譜曲線
(a):強(qiáng)壯前溝藻;(b):赤潮異灣藻;(c):中肋骨條藻;(d):三角褐指藻
3.2 藻種鑒別結(jié)果分析
將原始光譜(Raw)數(shù)據(jù)和經(jīng)過7種預(yù)處理(見表1)后的數(shù)據(jù)用兩種波段篩選方法(分別是GA和SPA)提取特征波段,然后采用SVM和反向傳播神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(BPNN)進(jìn)行建模,其結(jié)果如圖3所示。由圖3(a)可知基于Savitzky-Golay平滑的二階導(dǎo)數(shù)結(jié)合GA(SG+2nd-GA)的組合方法在采用SVM和BPNN兩種建模方法時(shí)都獲得了100%的準(zhǔn)確率,由圖3(b)可知SG+2nd-SPA組合方法在采用SVM和BPNN兩種建模方法時(shí)也分別取得了98.5%和96.2%的準(zhǔn)確率。結(jié)果表明恰當(dāng)?shù)念A(yù)處理方法可以提升波段篩選的準(zhǔn)確率,從而提高建模的精度。采用SG+2nd的預(yù)處理方法可以提高波段篩選和建模的準(zhǔn)確率,適用于低濃度具有相似光譜曲線的赤潮藻種鑒別。
圖3 四種赤潮藻經(jīng)(a)GA和(b)SPA提取特征波段的鑒別的結(jié)果
從圖3中還可以看出波段篩選方法對(duì)模型準(zhǔn)確率有關(guān)鍵性的影響,采用GA波段篩選方法時(shí),不同的預(yù)處理與建模方法對(duì)模型預(yù)測(cè)精度的影響較小(準(zhǔn)確率在93.9%~100.0%之間),而采用SPA波段篩選方法時(shí),不同預(yù)處理與建模方法對(duì)模型預(yù)測(cè)精度的影響較大(準(zhǔn)確率在18.9%~100.0%之間)。為了進(jìn)一步分析原因,表4列出了基于不同預(yù)處理算法GA和SPA提取出的特征波段。
由表4可知,GA提取的特征波段位于450.6~837.2nm之間,主要集中在450.6~494.0和552.7~644.7nm,這些波段位于藻細(xì)胞中不同色素對(duì)光的吸收波段范圍內(nèi)(見表3)。而SPA提取的特征波段位于386.2~1032.1nm之間,部分位于386.2~393.3和1032.1nm,這些波段在高光譜相機(jī)光譜探測(cè)范圍的兩端,受噪聲影響大,不適合作為代表藻種信息的特征波段。上述結(jié)果表明GA提取的特征波段更具代表性和有效性,而SPA提取的部分特征波段受噪聲影響大不利于建模。特征波段的代表性和有效性是影響藻種鑒別準(zhǔn)確率的關(guān)鍵。
表4 不同預(yù)處理算法處理后 GA和SPA所提取的特征波段
如表4所示,SG+2nd-GA提取的特征波段為547.8、562.6、644.7、829.4和832.0nm,這可能與不同微藻細(xì)胞內(nèi)色素種類和比例有關(guān)。其中547.8nm可能與巖藻黃素吸收有關(guān),巖藻黃素是赤潮異灣藻、中肋骨條藻和三角褐指藻主要色素之一,而在強(qiáng)壯前溝藻中不存在(見表3)。562.6nm波段則是受到Chla的影響。644.7nm可能是同時(shí)受到Chla和Chlc的影響。829.4和832.0nm是由于藻液中水的O—H鍵的作用。波段出現(xiàn)稍微偏移的原因可能是:
(1)不同藻種色素種類和比例不同;
(2)同藻種不同生長(zhǎng)周期色素含量不同;
(3)同藻種不同個(gè)體色素含量不同。綜上所述,SG+2nd-GA提取的波段是各藻種中不同色素對(duì)光吸收的特征波段,所以能夠100%成功鑒別強(qiáng)壯前溝藻、赤潮異灣藻、中肋骨條藻和三角褐藻。
3.3 藻細(xì)胞濃度預(yù)測(cè)模型結(jié)果分析
根據(jù)前面的描述,SG+2nd-GA的組合方式對(duì)4種赤潮藻的光譜曲線降噪和篩選特征波段具有一定的優(yōu)勢(shì)。圖4標(biāo)記了4個(gè)藻種SG+2nd-GA處理后的特征波段,其中,強(qiáng)壯前溝藻的特征波段是577.4、667.4、669.9、672.5和675.0nm,赤潮異灣藻的特征波段是654.8、667.4、672.5和675.0nm,中肋骨條藻的特征波段是669.9、672.5和675.0nm,三角褐指藻的特征波段是652.3、680.1和695.3nm。不同色素對(duì)特定波長(zhǎng)處的光吸收度是進(jìn)行濃度預(yù)測(cè)的可靠指標(biāo),利用葉綠素在684nm處對(duì)光的吸收度曾被用來測(cè)量近頭狀尖胞藻的細(xì)胞濃度,且模型預(yù)測(cè)R2達(dá)到0.9998。四種赤潮藻的濃度預(yù)測(cè)模型波段主要集中在紅光區(qū)域(620~780nm),該區(qū)域是Chla的主要吸收光譜范圍。其中強(qiáng)壯前溝藻、赤潮異灣藻和中肋骨條藻都選擇675nm作為特征波段之一,這與許多學(xué)者認(rèn)為Chla在675nm處有光譜吸收峰相一致。此外,577.4nm[如圖4(a)所示]作為強(qiáng)壯前溝藻細(xì)胞濃度特征波段,可能與強(qiáng)壯前溝藻富含有Chlc有關(guān),根據(jù)2.2中特征波段出現(xiàn)微偏移可能的原因,對(duì)四種赤潮藻濃度進(jìn)行預(yù)測(cè)時(shí)選擇的波段還與Ballardo等使用677nm處的吸收系數(shù)預(yù)測(cè)三角褐指藻的濃度相符合。
圖4 SG+2nd預(yù)處理后4種微藻的光譜曲線(紅點(diǎn)標(biāo)記處為 GA所選特征波段)
(a):強(qiáng)壯前溝藻;(b):赤潮異灣藻;(c):中肋骨條藻;(d):三角褐指藻
進(jìn)行藻種濃度測(cè)量時(shí),濃度范圍與測(cè)量誤差是考量模型價(jià)值的重要因素。如表5所示,應(yīng)用了三種建模方法(分別是多元線性回歸(MLR)、PLS和支持向量回歸(SVR))對(duì)四種赤潮藻建立濃度預(yù)測(cè)模型,結(jié)果表明四種赤潮藻的SVR建模集和預(yù)測(cè)集R2均大于0.98。其中,強(qiáng)壯前溝藻和中肋骨條藻模型濃度預(yù)測(cè)范圍分別在1.05×103~1.05×104和1.13×104~2.38×105cells·mL-1,最低濃度達(dá)到該藻種發(fā)生赤潮時(shí)的基準(zhǔn)濃度。相比商業(yè)型藻種(如小球藻、螺旋藻等),赤潮藻的細(xì)胞濃度較低,且葉綠素含量也較低,造成光譜反射率波動(dòng)范圍小,建模難度大,且建模精度將隨著細(xì)胞濃度的下降而急劇下降,這也是應(yīng)用光譜測(cè)量手段探測(cè)初期赤潮遇到的瓶頸。Ballardo等應(yīng)用分光光度計(jì)實(shí)現(xiàn)了三角褐指藻藻種濃度的預(yù)測(cè),達(dá)到的最低預(yù)測(cè)濃度為1.37×106cells·mL-1,而本工作應(yīng)用高光譜探測(cè)的手段實(shí)現(xiàn)對(duì)該藻種最低濃度1.06×105cells·mL-1的預(yù)測(cè),說明本文提出的SG+2nd-GA-SVR建模方法具有一定的先進(jìn)性。
表5 SG+2nd-GA處理后不同建模方法細(xì)胞濃度預(yù)測(cè)結(jié)果
如表5所示,SVR非線性建模方法,效果優(yōu)于MLR和PLS線性建模效果??赡艿脑蚴俏⒃寮?xì)胞濃度預(yù)測(cè)模型主要建立微藻細(xì)胞內(nèi)色素濃度與吸收系數(shù)之間的關(guān)系。由于“包絡(luò)效用”使色素濃度與赤潮藻吸收系數(shù)之間并不是簡(jiǎn)單的線性關(guān)系,而是一種復(fù)雜的非線性變化,如Chla與光譜反射率之間存在冪指數(shù)關(guān)系。
4 結(jié)論
采用高光譜測(cè)量手段對(duì)強(qiáng)壯前溝藻、赤潮異灣藻、中肋骨條藻和三角褐指藻四種赤潮藻種進(jìn)行鑒別和細(xì)胞濃度測(cè)量。比較了7種預(yù)處理方法和2種數(shù)據(jù)降維方法,結(jié)果表明SG+2nd-GA的組合方式對(duì)這四種赤潮藻的光譜曲線隆噪和特征波段提取具有一定的優(yōu)勢(shì),通過提取5個(gè)波段與SVM或BPNN結(jié)合能100%鑒別這四種微藻。藻細(xì)胞模型濃度預(yù)測(cè)結(jié)果表明色素是判斷赤潮濃度的一個(gè)重要因素。此外,SG+2nd-GA-SVR在三種濃度預(yù)測(cè)模型中預(yù)測(cè)結(jié)果最好,四種藻預(yù)測(cè)模型R2均大于0.98,其中強(qiáng)壯前溝藻和中肋骨條藻最低預(yù)測(cè)濃度達(dá)到該藻種發(fā)生赤潮時(shí)的基準(zhǔn)濃度,三角褐指藻突破了現(xiàn)有光譜技術(shù)對(duì)其預(yù)測(cè)的最低濃度。本研究所建立的高光譜反射系統(tǒng)藻種鑒別和濃度預(yù)測(cè)方法,為快速、無損探測(cè)赤潮提供了新方法,為赤潮監(jiān)測(cè)和防治提供了新依據(jù)。
推薦:
便攜式高光譜成像系統(tǒng) iSpecHyper-VS1000
專門用于公安刑偵、物證鑒定、醫(yī)學(xué)醫(yī)療、精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)、礦物地質(zhì)勘探等領(lǐng)域的最新產(chǎn)品,主要優(yōu)勢(shì)具有體積小、幀率高、高光譜分辨率高、高像質(zhì)等性價(jià)比特點(diǎn)采用了透射光柵內(nèi)推掃原理高光譜成像,系統(tǒng)集成高性能數(shù)據(jù)采集與分析處理系統(tǒng),高速USB3.0接口傳輸,全靶面高成像質(zhì)量光學(xué)設(shè)計(jì),物鏡接口為標(biāo)準(zhǔn)C-Mount,可根據(jù)用戶需求更換物鏡。